LabDAO tworzy wykresy przyszłości sztucznej inteligencji typu open source do odkrywania leków

Projekt Folding@home trafiał na pierwsze strony gazet podczas pandemii COVID-19 w celu zgromadzenia niewykorzystanej mocy obliczeniowej w celu zbadania przestrzeni wyszukiwania zwijania białek w celu zwalczania nowego koronawirusa. Umożliwiając obywatelom samodzielne bycie naukowcami, w ramach inicjatywy przeprowadzono symulacje na dużą skalę różnych konfiguracji molekularnych białek w rozproszonej sieci „zarejestrowanych” komputerów na całym świecie.

Ten zdecentralizowany paradygmat został zapowiedziany w celu łączenia ludzi wokół wspólnego problemu i wydajnego pozyskiwania mocy obliczeniowej w ramach crowdsourcingu, ale co by było, gdyby moc obliczeniowa i infrastruktura rozwiązywania problemów zostały odwrócone? Innymi słowy, co by było, gdyby jednostki mogły prowadzić własne projekty, wykorzystując zgromadzoną moc obliczeniową i narzędzia do eksperymentów biologicznych?

LabDAO urzeczywistnia to marzenie dzięki platformie PLEX. PLEX to narzędzie wiersza poleceń typu open source, zaprojektowane tak, aby udostępniać nie tylko zasoby obliczeniowe, ale także różnorodne narzędzia biologicznego uczenia maszynowego (ukute w pakiecie „BioML” w ramach LabDAO) na różnych środowiskach. Niezależnie od tego, czy eksperymentujesz z dokowaniem małych cząsteczek, czy własnymi symulacjami fałdowania białek, PLEX pozwala użytkownikom korzystać z biblioteki narzędzi LabDAO, udostępniać wyniki i wizualizować je w mniej niż pięć minut.

Ten zestaw narzędzi i platforma umożliwiająca jego użytkowanie została zaprezentowana na szczycie Zuzalu Blockchain Meets Biology na początku kwietnia, gdzie członek zespołu LabDAO, Lily Hansen-Gillis, zademonstrowała od początku do końca symulację wewnętrznej dynamiki molekularnej białko, aby znaleźć jego najbardziej stabilną konfigurację. Następnie, jako samozwańcza „niekodująca”, przeprowadziła publiczność przez cały proces od początku do końca — wszystko z komputerem, Wi-Fi, PLEX-em w wierszu poleceń i niczym więcej.

Mówiąc szerzej, LabDAO to zdecentralizowana platforma obsługująca Web3 (część większego ruchu „DeSci”), której celem jest tworzenie bardziej produktywnego środowiska do odkrywania leków opartego na otwartym kodzie źródłowym. Udostępniając najnowocześniejsze narzędzia i zasoby szerszemu ekosystemowi, LabDAO ma na celu stworzenie odpowiedniego środowiska dla przejrzystych i dostępnych postępów naukowych. Niezależnie od tego, czy eliminując potrzebę posiadania przez badaczy własnego sprzętu lub infrastruktury obliczeniowej, czy też publikując wyniki eksperymentów w księdze blockchain, tak aby były one wykonalne i odtwarzalne, organizacja jest zaangażowana w umożliwienie większej innowacyjności poprzez współpracę — przełamując bariery spowodowane słabymi użyteczność i silosowa, niszowa wiedza specjalistyczna.

Wysiłki LabDAO mające na celu zbudowanie tego przyszłościowego świata DeSci na dzień dzisiejszy otrzymały niedawno impuls w postaci rundy finansowania w wysokości 3.6 miliona dolarów od różnych innych organizacji DAO, Inflection.xyz, Balaji Srinivasan i innych. Ten napływ wsparcia przyczyni się do ciągłych wysiłków na rzecz tworzenia narzędzi oprogramowania typu open source i wzmocnienia ekosystemu badawczego LabDAO.

Jeśli chodzi o sam PLEX, najbliższe najbliższe kroki na horyzoncie obejmują testowanie platformy w ramach różnych współpracy naukowych, konteneryzację różnych narzędzi i gromadzenie niezbędnego sprzętu do wspierania sieci BioML.

Jeśli chodzi o perspektywę długoterminową, być może kolejny lek ratujący życie podczas następnej poważnej epidemii choroby zakaźnej zostanie zaprojektowany z mocą PLEX, po jednym zdecentralizowanym kroku naprzód. W miarę rozwoju ekosystemu, tylko czas pokaże.

Dziękuję Aishani Aatresh w celu uzyskania dodatkowych badań i raportów na temat tego artykułu. Jestem założycielem SynBioBeta, a niektóre z firm, o których piszę, są sponsorami Konferencja SynBioBeta. Aby uzyskać więcej treści, możesz subskrybować mój cotygodniowy biuletyn.